2月23日，中央政治局召开会议，讨论通过了《国务院机构改革和职能转变方案(草稿)》。该草案已列入十八届二中全会的议题之一。

1月11日，由张高丽主持召开的座谈会上，中国(海南)改革发展研究院院长迟福林就提出，大部制改革总体方案尚未出台前，只对职能交叉重叠、矛盾问题比较突出的部门进行机构调整，而不急于全面推进大部门制改革和政府机构调整。

根据媒体公开报道，此次国务院机构改革包括民政部扩大社会管理等方面的权责；食品安全监管部门整合，成立专门的市场秩序监管部门；国家海洋局扩权，强化海洋综合管理权限；铁道部与交通运输部有望整合。而对于此前引发广泛议论的“大能源”、“大文化”、“大农业”、“大金融”等部门改革，相关人士接受媒体采访时称，“还不到时候”。

一位曾多次参与大部制方案人士透露，国务院部门之间至少有80多项职责是相互交叉的。比如，人力资源管理方面，人社部、教育部职能存在交叉。城市供水、地下水管理方面，水利部、国土部等相关政府部门职能存在交叉。本轮大部制改革，仅涉及到海洋的垂直管理，扩大国家海洋局的职能。

食品安全监管方面，卫生部、质检部门、工商管理部门均有涉及。本轮改革，有可能将国家食品药品监督管理局从卫生部门剥离出来，与国务院食品安全委员会办公室合并，同时撤销其他部门食品、药品安全监管职能，成立正部级国家食品药品安全监督管理总局。

能源方面，发改委、商务部、电监会，包括国防科工委等部门职能也有交叉。本轮大部制改革，尚未传出对部门整合的消息，目前的能源局仍为发改委直属的副部级单位。

而铁道部是否在本轮改革中并入交通运输部是一个热点话题。国家发改委综合运输研究所研究员董焰表示，上次大部制改革之所以没有被合并是因为有关部门的领导受了时任铁道部部长刘志军的影响。刘志军当时称，铁路尤其是高铁攸关国家的军事和国防事业，兹事体大，不能贸然把其权归并到其他部门。

根据媒体公开报道，此轮大部制改革方案通过后，各个相关部委将集中拿出“三定”方案。